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Vou deixar aqui um tutorial para instalar, fazer o boot e correr o Ubuntu a partir duma pen USB. Utilizando várias partições, o utilizador pode salvar alterações e definições nessa mesma pen USB.

Material que se pode arranjar em qualquer farmácia:

• 1GB pen USB ou maior
• Bootable Ubuntu Live CD
• USBubuntu.zip

Tutorial:

 1. Faz o download do Xubuntu 6.10 e grava-o num CD
 2. Faz o download do USBubuntu.zip
 3. Insere o LiveCd do Xubuntu que gravaste na drive e faz o reboot ao PC (boot pelo Xubuntu)
 4. Insere a pen USB de 1GB ou mais
 5. Abre um terminal e escreve: sudo su
 6. Escreve agora fdisk -l para veres as drives/partições disponíveis (Vê qual é o device da tua pen, talvez seja /dev/sda)
 7. Escreve: umount /dev/sda1 (substitui o sda1 pelo device onde está a tua pen)
 8. Escreve: fdisk /dev/sda (substitui o sda pelo device da tua pen)
 9. Escreve: d (isso apagará a partição existente)
10. Escreve: p (para mostrar partições existentes, e se existir, repete o passo 9)
11. Escreve: n (para criar nova partição)
12. Escreve: p (cria partição primária)
13. Escreve: 1 (faz com que seja a primeira partição)
14. Faz enter para usares o 1º cilindro por omissão
15. Escreve: +700M (para configurares o tamanho da partição)
16. Escreve: a (torna a partição activa)
17. Escreve: 1 (para selecionar a partição 1)
18. Escreve: t (altera o sistema de ficheiros da partição)
19. Escreve: 6 (para selecionar o sistema de ficheiros FAT16)
20. Escreve: n (para criares nova partição)
21. Escreve: p (para partição primária)
22. Escreve: 2 (para que seja a segunda partição)
23. Faz enter para usares o cilindro por omissão
24. Faz enter novamente para usares o último cilindro por omissão
25. Escreve: w (para escrever o novo mapa de partições)
26. Escreve: umount /dev/sda1 (para desmontar a partição)
27. Escreve: mkfs.vfat -F 32 -n USB /dev/sda1 (formata a primeira partição, troca sda1 pela tua partição correta se necessário)
28. Escreve: mkfs.ext2 -b 4096 -L casper-rw /dev/sda2 (formata a segunda partição, troca sda2 pela tua partição correta se necessário)
29. Faz agora um reboot ao PC e entra no Windows, não esqueças de retirar o LiveCD
30. Extrái o conteúdo do USBubuntu.zip para dentro da tua pen USB
31. Navega para dentro da tua pen USB e executa o Makeboot.exe (nunca executes este binário no teu PC!!)
32. Segue as instruções
33. Faz novo reboot ao PC e configura a tua BIOS para arrancar primeiro a partir do USB-HDD ou USB-ZIP.

Um alerta, o arranque do Ubuntu é um pouco mais lento que o de outras distros, mas depois de arrancar é estável e rápido. É necessário o .Net Framework para correr o Makeboot.exe, podes fazer o download do mesmo aqui.

Fonte: Pendrivelinux.com